MC-EA03
Programação em R para BioInformática

Professor: Amanda Araújo Serrão de Andrade (UFRJ) e Douglas Terra Machado (LNCC)

Horarios: Quarta 23 e Sexta 25 de 11:30h às 13:00h

Ementa:
  1. Aula 1
    • Ambientes R e RStudio.
    • Operações matemáticas básicas
    • Instalação e utilização de pacotes
    • Vetores, matrizes, fatores e listas
    • Tipos de classes no R
    • Indexação
    • Criação de fuções
    • Introdução ao pacote tidyverse
  2. Aula 2
    • Manipulação de data frames
    • Operadores lógicos e de comparação
    • Funções condicionais
    • Loopings: for e while
    • Aplicações de estatística descritiva usando o R
  3. Aula 3
    • Importação de dados ao R
    • Introdução a Bioinformática
    • Introdução ao Biocondutor: Pacote SeqinR, exemplos em bioinformática
  4. Aula 4
    • Pré-Processamento de dados biológicos
    • Visualização dos dados e construção de gráficos
    • Construção de gráficos com o pacote ggplot2:
      • Camadas
      • Tipos de gráficos e apresentação do R Graph Gallery
      • Personalização e utilização do RcolowBrewer
      • Exemplos em bioinformática